No jogo os Combine usam o portal de Xen para Terra (Black Mesa) para transportar suas tropas, eles levam para todo planeta Drop Ships, que são naves com contâiners, que trazem aparelhagem blindada e material belico, trazem Gun Ships uma especie de helicóptero, e tambem trazem...

Dr. Breen faz de seu lar o alto da Cidatel em City 17. Breen evitando que a humanidade tente algo contra ele, ele remaneja pessoas entre as cidades, fazendo constantes conexões. Ele controla toda midia no planeta, tambem instala grandes teloes nos centros das cidades passando a mensagem de que ...

Neste momento do Jogo, Gordon Freeman é novamente chamado, G-man o retira do sono e deixa que Gordon faça seu trabalho novamente. Gordon acorda em meio a revolta de uma alianca rebelde, que luta contra Breen. Breen descobre que Gordon esta devolta, devido a um erro ocorrido no portal ...